教育部重点实验室
· 复杂系统安全与控制教育部重点实验室
· 非线性分析数学与应用教育部重点实验室
教育部工程研究中心
· 肿瘤与病菌靶向新药创制教育部工程研究中心
教育部战略研究培育基地
· 重庆大学区域经济与科教战略研究中心
教育部国际合作联合实验室
· 轻合金材料国际合作联合实验室
· 自主无人系统安全与控制国际合作联合实验室
教育部医药基础研究创新中心
· 智能肿瘤学医药基础研究创新中心
其它部委平台
· 农业部农作物生态环境安全监督检测测试中心（重庆）
· 煤矿灾害预防与处置应急管理部重点实验室
· 民政部政策理论研究基地
· 国土空间规划监测评估预警重点实验室
重庆市重点实验室
· 生物电磁医疗高端装备重庆市重点实验室
· 轻金属材料科学与成型技术重庆市重点实验室
· 三峡库区水环境安全重庆市重点实验室
· 物流与供应链创新重庆市重点实验室
· 大数据智能与隐私计算重庆市重点实验室
· 非均质材料力学重庆市重点实验室
· 洁净能源与绿色化工过程重庆市重点实验室
· 材料基因高通量表征技术重庆市重点实验室
· 天然产物合成与创新药物研究重庆市重点实验室
· 钒钛特色资源绿色冶金及新材料重庆市重点实验室
· 分析数学与应用重庆市重点实验室
· 山地工程结构抗震防灾重庆市重点实验室
· 植物激素调控与分子育种重庆市重点实验室
· 空天地网络智联与信息融合重庆市重点实验室
· 恶性肿瘤转移机制与干预重庆市重点实验室
· 强耦合体系微观物理重庆市重点实验室
· 风工程及风资源利用重庆市重点实验室
· 先进模具智能制造重庆市重点实验室
· 乳腺癌智能诊疗重庆市重点实验室
· 急诊医学重庆市重点实验室
川渝共建重点实验室
· 氢能绿色制储与高效利用川渝共建重点实验室
· 安全节能环保土木工程先进新材料川渝共建重点实验室
重庆市“一带一路”联合实验室
· 重庆一匈牙利先进激光与肿瘤早期发现“一带一路”联合实验室
重庆市技术创新中心
· 重庆市轻量化材料技术创新中心
· 重庆市道地药材质量评价与鉴定技术创新中心
· 重庆市风光能源工程结构技术创新中心
重庆市工程技术研究中心
· 重庆市镁合金工程技术研究中心
· 重庆市网络化制造工程技术研究中心
· 重庆市材料表面精密加工及成套装备工程技术研究中心
· 重庆市微光机电工程技术研究中心
· 重庆市杀虫真菌农药工程技术研究中心
· 重庆市医疗电子工程技术研究中心
· 重庆市机电传动与智能控制工程技术研究中心
· 重庆市交通物联网工程技术研究中心
· 重庆市血液净化装备工程技术研究中心
· 重庆市高性能混凝土工程技术研究中心
· 重庆市无线电能传输工程技术研究中心
· 重庆市特种通信与组网工程技术研究中心
· 重庆市生物医学电磁技术与数字诊疗设备工程技术研究中心
· 重庆市生智能交通（ITS）工程技术研究中心
重庆市基础学科研究中心
· 重庆市量子物理基础学科研究中心
重庆市野外科学观测研究站
· 三峡库区库岸滑坡灾害重庆市野外科学观测研究站
· 三峡库区河湖生态系统重庆市野外科学观测研究站
重庆市临床医学研究中心
· 重庆市肿瘤学临床医学研究中心
· 重庆市内分泌代谢病学临床医学研究中心
· 重庆市老年疾病临床医学研究中心
重庆市国际联合研发中心
· 中新无线电能传输技术国际联合研发中心
· 中-美重庆大学帕克国际联合研发中心
重庆市工程研究中心
· 环保重庆市工程研究中心
· 多能互联互补分布式能源技术及系统重庆市工程研究中心
· 能源互联网与智能电力装备重庆市工程研究中心
· 智慧无人系统重庆市工程研究中心
· 肿瘤临床多组学大数据应用重庆市工程研究中心
· 山地人居环境工程与综合技术重庆市工程研究中心
· 无线电能传输技术重庆市工程研究中心
· 高性能集成电路重庆市工程研究中心
· 先进铸造重庆市工程研究中心
协同创新中心(2011计划)
· 山地城镇建设防灾与减灾重庆市协同创新中心（市级）
· 重庆市深空巡视探测协同创新中心（市级）
· 能源互联网与智能装备重庆市协同创新中心（市级）
· 钢结构与建筑工业化协同创新中心（市级）
· 地方政府治理协同创新中心（市级）
